นักวิจัยได้ใช้แนวทางชีววิทยาของระบบเพื่อแยกวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของ ลอสริไดออยเดส ดิฟิไซล์ ซึ่งเป็นเชื้อก่อโรคที่เป็นปัญหาโดยเฉพาะในสถานพยาบาล ศูนย์ควบคุมโรคประมาณการว่าแบคทีเรียทำให้เกิดการติดเชื้อประมาณ 500,000 รายในสหรัฐอเมริกาทุกปี โดยมีอาการท้องร่วงรุนแรงและลำไส้ใหญ่อักเสบเป็นอาการเฉพาะ

ลอสริไดออยเดส ดิฟิไซล์เป็นสาเหตุสำคัญที่สุดของการติดเชื้อที่เกี่ยวข้องกับโรงพยาบาล ส่วนหนึ่งจากการใช้ยาปฏิชีวนะ ซึ่งสามารถฆ่าเชื้อแบคทีเรียที่มีสุขภาพดีได้มากพอที่จะปล่อยให้ C. difficile เติบโตโดยไม่มีการตรวจสอบ การติดเชื้อเป็นอันตรายอย่างยิ่งในผู้สูงอายุ CDC รายงาน ใน 1 ใน 11 ของผู้ที่มีอายุเกิน 65 ปีซึ่งได้รับการวินิจฉัยว่าเป็นกรณีที่เกี่ยวข้องกับโรงพยาบาลของC. difficileเสียชีวิตภายในหนึ่งเดือน C. diff เป็นแบบถาวรและแพร่หลาย ไม่ก่อให้เกิดอาการท้องร่วงทั่วไป คนส่วนใหญ่ฟื้นตัว แต่บางคนป่วยหนัก ต้องรักษาตัวในโรงพยาบาล และบางคนเสียชีวิตจากโรคแทรกซ้อน เช่น ไตวายหรือภาวะติดเชื้อเพื่อให้เข้าใจลักษณะทางพันธุกรรมของC. difficile ได้ดีขึ้น และพัฒนาแบบจำลองที่สามารถระบุและทำนายวิวัฒนาการที่ซับซ้อนและคงที่ได้ นักวิจัยจึงใช้การจัดลำดับจีโนมทั้งหมด การตรวจคัดกรองฟีโนไทป์ในปริมาณมาก และการสร้างแบบจำลองการเผาผลาญของแบคทีเรีย 451 สายพันธุ์